🗒️《Light-Sheet显微图像处理手册》
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Chapter 1 Introduction1.1 Light-Sheet显微图像介绍1.2 下载Python1.3 设置Conda环境1.4 下载Fiji1.5 下载IMarisChapter 2 Python 基础Chapter 第三方库使用Chapter 3 图像分析基础读取.tif/tiffmatplotlib 保存.png读取.mha读取.nii/.nii.gz滑动条展示nii数据读取nii展示三视MIPpercentile normalization Chapter 图像分析案例
Chapter 1 Introduction
1.1 Light-Sheet显微图像介绍
1.2 下载Python
1.3 设置Conda环境
1.4 下载Fiji
1.5 下载IMaris
Chapter 2 Python 基础
To be continued …
Chapter 第三方库使用
- nibabel
- monai
- nnUNet
Chapter 3 图像分析基础
读取.tif/tiff
matplotlib 保存.png
读取.mha
读取.nii/.nii.gz
滑动条展示nii数据
为了方便在notebook中可视化单张图片，可以结合滑动条slider来显示